Le Conseil d’Administration Il est l’organe de décision de l’AnpE. Il est investi des pouvoirs les plus étendus pour agir en toutes circonstances au nom de celle-ci. Le Conseil d'Administration exerce ses pouvoirs dans les limites de l'objet social. Il est composé de représentants :
1- SEHLIN Edouard, Représentant du Ministre en charge des Petites et Moyennes Entreprises(MPMEPE) ;
2- HOUSSOU Serge-Hervé, Représentant du Président de la République;
3- OLOGOUDOU Armand, Représentant du Ministre de l'Economie et des Finances(MEF);
4- SANOUSSI Mouhamadou Hadirou B., Représentant du Ministre du Travail et de la Fonction Publique(MTFP);
5- NADJO Bernard, Représentant du Conseil National du Patronat du Bénin(CNPB);
6- GIBIGAYE ADAM Boukary, Représentant de la Chambre de Commerce et d'Industrie du Bénin (CCIB)
7- SOSSOU-HOLONOU Francoise Pauline ADAM Boukary, Représentant du Centre Scientifique et Technique du Bâtiment(CSTB);